L'étang de Thau est en fait d'une lagune séparée de la Méditerranée par un cordon de sable littoral reliant le volcan d'Agde et la colline de Sète (le Mont Saint-Clair). Il se prolonge à l'est par l'étang des Eaux-Blanches, aujourd'hui partiellement comblé. A l'ouest, on trouve l'étang et le marais du Bagnas , propriétés du Conservatoire du littoral et réserve ornithologique protégée. Au lieu-dit "les Onglous", le canal du Midi se jette dans l'étang de Thau qui le relie de ce fait à la mer Méditerranée. Le canal du Rhône à Sète le relie au Rhône.

 

Administrativement, l'étang est partagé entre les 7 communes héraultaises de Sète, Frontignan, Balaruc-les-Bains, Balaruc-le-Vieux, Bouzigues, Loupian, Mèze et Marseillan .